มะเร็งหลอดอาหาร เกิดจากการเจริญเติบโตผิดปกติของเซลล์ในเยื่อบุหลอดอาหาร ซึ่งอาจมีสาเหตุจากปัจจัยเสี่ยงหลายประการ ดังนี้